Im EBUS-Generator-C werden alle Programme plattform- und betriebssystemunabhängig erstellt. Bei der Verwendung der integrierten EBUS-Indexdateien bleibt die Plattformunabhängigkeit erhalten, da die EBUS-Indexdateien auf jede Zielplattform binärkompatibel abgebildet werden. Es können also Indexdateien, die z.B. unter Linux  erstellt wurden ohne Probleme unter Windows verwendet werden und umgekehrt.

Darüberhinaus werden die Windows-ODBC- und die Java-JDBC-Schnittstelle unterstützt, die einen herstellerunabhängigen Zugriff auf alle gängigen SQL-Datenbanken erlauben.